يعتمد عمل النظام المحاسبي بشكل اساسي على نظام المخازن ,لما لة من اهمية في العمل الخاص بالمنشئات , حيث يستطيع المستخدم من خلال هذا النظام إدخال بيانات المستودعات والاصناف التي تخزنها المنشاة اما لغرض البيع او لغرض استخدامها ضمن المنشأة ,كما يتم من خلال هذا النظام مراقبة حركة المخزون من خلال توفير مجموعة من الأجراءات التي تدير عملية توريد وصرف المواد من والى المستودعات,ويوفر النظام إمكانية تصنيف كل مستند من مستندات المخازن سواء الصرف او التوريد الى مجموعة من الانواع حسب سياسة المنشأة,كما يوفر النظام ادارة متكاملة للطلبات وتحويل هذه الطلبات الى اوامر فعلية ومن ثم طباعة تقارير الجرد والانحرافات ودوران الاصناف,كما يدعم النظام طريقة الجرد الدوري والجرد المستمر,ويدعم النظام التعامل بطرق متعدده لاحتساب التكاليف(الوارد اولاً صادر اولاً ,الوارد اخراً صادر اولاً ,المتوسط المرجع).